簡化獲取與部署
為了開啟設(shè)計(jì)與構(gòu)建過程,使加州大學(xué)歐文分校能夠獲得高級(jí)工具,在更少的時(shí)間內(nèi)進(jìn)行更多的科學(xué)研究,Dell和Intel一起將加州大學(xué)歐文分校帶入了Intel的集群就緒項(xiàng)目中。Intel集群就緒驗(yàn)證包括全面的測試與集成工作,這一舉動(dòng)使Dell的HPC集群與Intel集群就緒驗(yàn)證的獲取與部署過程大大簡化。
加州大學(xué)歐文分校同樣利用Dell的硬件定制服務(wù)集成了硬件,鏡像,應(yīng)用程序,外圍設(shè)備以及系統(tǒng)文檔。
Crawford 說:“通過Dell的集成工作,產(chǎn)品進(jìn)行了預(yù)集成并進(jìn)入到我們的集群當(dāng)中。在監(jiān)控并管理日常事務(wù)時(shí),我們能夠更有效率也更加精通。GreenPlanet HPC采用的是Linux系統(tǒng),在系統(tǒng)中我們運(yùn)行了多個(gè)應(yīng)用程序。在超過30名教授及其研究團(tuán)隊(duì)當(dāng)中,運(yùn)行了各種不同的軟件,而且許多模擬要運(yùn)行數(shù)天或數(shù)個(gè)星期。正式由于Dell和Intel提供的專業(yè)服務(wù),我們才能夠借助Intel的集群就緒項(xiàng)目以及Dell的硬件定制服務(wù)進(jìn)行集群的集成。這為我們在一個(gè)開放平臺(tái)上監(jiān)控并管理眾多不同的活動(dòng)提供了幫助?!?/P>
快速治愈疾病
加州大學(xué)歐文分校使用GreenPlanet集群加速了科學(xué)研究,結(jié)果可能是能夠更快地治愈神經(jīng)退變性疾病,比如ALS,多發(fā)性硬化癥,帕金森癥,亨廷頓氏病以及細(xì)胞退化。這些疾病都是由于用于規(guī)范神經(jīng)的離子通道亞基或蛋白質(zhì)功能紊亂所致。
加州大學(xué)歐文分校的教授Douglas Tobias正在致力于計(jì)算化學(xué)的研究。計(jì)算化學(xué)模擬分子級(jí)別中的蛋白質(zhì)如何在電壓門控性離子通道中打開與關(guān)閉以對電壓的變化做出反應(yīng)。這正是所謂的動(dòng)作電位的基礎(chǔ),動(dòng)作電位是肌肉,神經(jīng)以及易興奮的組織中的電信號(hào)。
Douglas Tobias 說:“當(dāng)開始我的研究時(shí),看到能夠模擬大約800個(gè)原子進(jìn)行尖端研究我非常高興?,F(xiàn)在使用GreenPlanet一般能夠模擬25萬的原子而且在今后能夠達(dá)到兩到三個(gè)數(shù)量級(jí)的規(guī)模。這樣一來,我們能夠研究的系統(tǒng)已經(jīng)完全改變了。我們已經(jīng)從小型分子發(fā)展為高分子的大型裝配體。這開創(chuàng)了你可以考慮的問題類型的新場景。我們能夠抽樣的基礎(chǔ)分布或動(dòng)態(tài)分布越多,我們對結(jié)果也就越有信心。有時(shí)只要運(yùn)行比較久的時(shí)間就能看到之前不能看到的結(jié)果,這在之前是難以想象的。這的的確確改變了我們的研究?!?/P>
研發(fā)新藥物
藥劑學(xué)與計(jì)算機(jī)科學(xué)的助理教授Rommie Amaro正在研究各種不同的傳染性疾病,她說:“在我的試驗(yàn)中,我們正在使用不同的計(jì)算模擬以試圖了解傳染性疾病中的酶和生物分子如何活動(dòng)以及我們能夠如何研制出新藥物命中這些特定的酶。我們研究具有成百乃至上千種原子的系統(tǒng)并模擬這些原子的行為。因此,對我們來說訪問具有快速連接的大量處理器非常重要。這讓我們能夠更加快速地獲得結(jié)果。GreenPlanet的偉大之處在于它滿足了我們的限制條件?!?/P>
Crawford 說:“我們是如此興奮,如此激動(dòng),因?yàn)镽ommie Amaro博士正在進(jìn)行生物合成這一尖端領(lǐng)域的研究。我們非常希望這些發(fā)現(xiàn)在不久的將來能夠?qū)е潞铣晌镛D(zhuǎn)化為新藥物并用于新的應(yīng)用?!?/P>