中國(guó)IDC圈2月25日?qǐng)?bào)道:基因測(cè)序是國(guó)際公認(rèn)的基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。作為精準(zhǔn)醫(yī)療的重要手段,基因測(cè)序能鎖定個(gè)人病變基因。
在10年前,基因測(cè)序成本約為幾十億美金;5年前喬布斯患上胰腺癌之時(shí),做全基因測(cè)序的費(fèi)用已經(jīng)降到了十萬美金;到2015年,全基因測(cè)序成本進(jìn)一步降到了1000美金。
雖然基因測(cè)序成本的下降速度非???,但對(duì)基因數(shù)據(jù)的分析還沒有跟上。
每個(gè)人都有23000多個(gè)基因,相應(yīng)的全基因測(cè)序數(shù)據(jù)結(jié)果可達(dá)幾百GB到1TB之間。如何在基因突變與已知疾病之間建立關(guān)系,需要基因大數(shù)據(jù)與疾病大數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性分析。這難在一方面需要大數(shù)據(jù)分析能力,另一方面還需要跨學(xué)科知識(shí)指導(dǎo)。
數(shù)據(jù)分析需要一個(gè)數(shù)學(xué)模型作為初始起點(diǎn),再用大數(shù)據(jù)對(duì)這個(gè)數(shù)學(xué)模型不斷進(jìn)行優(yōu)化。對(duì)于數(shù)據(jù)分析來說,有三個(gè)通用數(shù)學(xué)模型:統(tǒng)計(jì)模型、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和專家知識(shí)系統(tǒng)。其中前二者偏向純數(shù)學(xué)方式且需要海量計(jì)算,而專家知識(shí)系統(tǒng)則結(jié)合了行業(yè)專業(yè)知識(shí),在提高分析效率的同時(shí)減少了計(jì)算量。
十年前,還在讀碩士的余偉師就已經(jīng)開始研究基因與疾病、基因與癌癥的關(guān)系。他于2005至2010年先后在國(guó)際知名雜志上發(fā)表了7篇基因表達(dá)與健康及疾病相關(guān)的論文。2010年底,余偉師從華東師大生物醫(yī)學(xué)專業(yè)博士畢業(yè)后,進(jìn)入美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院NIH從事博士后研究。
余偉師在一直在思考如何將自己研究了10多年的基因知識(shí)貢獻(xiàn)給國(guó)內(nèi)的醫(yī)療健康事業(yè)。當(dāng)時(shí)美國(guó)的基因數(shù)據(jù)分析正蓬勃發(fā)展,而中國(guó)在這方面還很不成熟——成本高、時(shí)效低、缺乏中國(guó)人自己的基因數(shù)據(jù)庫(kù)。而針對(duì)疾病尤其是癌癥的復(fù)雜性,還必須與更多交叉學(xué)科的專家,一起解決臨床遇到的問題。
余偉師從這個(gè)思路出發(fā)逐漸聚集了64位華人博士,當(dāng)中不乏頂尖機(jī)構(gòu)的教授。64位華人博士湊在一起做什么呢?簡(jiǎn)單說,就是在自己的工作之余,把醫(yī)學(xué)相關(guān)文獻(xiàn)里關(guān)于某基因突變與某疾病(以腫瘤為主)之間的潛在關(guān)系收集起來,形成一個(gè)專家知識(shí)庫(kù)。然后再把這種潛在對(duì)應(yīng)關(guān)系,與美國(guó)現(xiàn)有臨床結(jié)果作印證,構(gòu)建成專業(yè)的數(shù)據(jù)庫(kù)。
經(jīng)過兩年多的努力,這個(gè)團(tuán)隊(duì)已經(jīng)把公共數(shù)據(jù)里關(guān)鍵的疾病信息都搜集出來并進(jìn)行了驗(yàn)證。該數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)找出了11000多個(gè)與腫瘤疾病相關(guān)聯(lián)的基因和相對(duì)應(yīng)的位點(diǎn),也就是說已經(jīng)整合了人體一半以上的基因,其它的還處于未知階段。
64 位博士之所以通過類「眾籌」的方式建立這個(gè)專家知識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù),最初的動(dòng)力是在閱讀和摘錄醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的時(shí)候需要專業(yè)的辨別能力。即使是某個(gè)醫(yī)學(xué)專業(yè)的博士,如果水平不夠或是在某個(gè)疾病領(lǐng)域研究不夠透,都無法辨別文獻(xiàn)中結(jié)論的準(zhǔn)確性。而這64個(gè)博士在不同醫(yī)學(xué)和疾病領(lǐng)域各有專長(zhǎng),因此具備專業(yè)篩查能力。
當(dāng)余偉師的團(tuán)隊(duì)帶著自己的科研成果回國(guó)交流時(shí),立刻就受到了國(guó)內(nèi)醫(yī)療機(jī)構(gòu)和第三方檢驗(yàn)所的注意,團(tuán)隊(duì)所掌握的技術(shù)在合作單位進(jìn)行了充分試驗(yàn),并得到積極的反饋。于是,余偉師放棄了即將申請(qǐng)下來的2016年150萬美元的NIH個(gè)人研究經(jīng)費(fèi)以及晉升NIH研究員的機(jī)會(huì),還放棄了申請(qǐng)中的美國(guó)綠卡,回國(guó)創(chuàng)業(yè)成立了賽福基因公司。
賽?;蛴兄鴱?qiáng)大的專家隊(duì)伍,其技術(shù)總監(jiān)為耶魯大學(xué)應(yīng)用數(shù)學(xué)博士,在美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)長(zhǎng)年從事生物信息學(xué)分析,擁有深厚的數(shù)學(xué)功底、豐富的生物信息分析經(jīng)驗(yàn)。賽?;虻氖袌?chǎng)總監(jiān)為美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)博士,在美國(guó)從事了近二十年的膀胱癌研究。2016年還將有20余位醫(yī)學(xué)博士回國(guó)加入賽福基因,同時(shí)也將與美國(guó)各大醫(yī)學(xué)科研機(jī)構(gòu)形成深度合作,通過眾籌合作共同推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療技術(shù)發(fā)展。
賽?;蚪Y(jié)合云計(jì)算技術(shù),以基于智能機(jī)器學(xué)習(xí)的方式,自動(dòng)化地為醫(yī)院健康類B端客戶提供基因大數(shù)據(jù)分析。賽?;蚰壳爸饕c國(guó)內(nèi)三甲醫(yī)院以及癌癥領(lǐng)域頂尖醫(yī)院合作,這些醫(yī)院集合了國(guó)內(nèi)比較權(quán)威的樣本庫(kù),與賽?;虻幕A(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)合起來后,對(duì)建立中國(guó)人自己的疾病基因數(shù)據(jù)庫(kù)將起重要作用。
賽?;蛴?015年下半年加入了微軟創(chuàng)投加速器,目前已經(jīng)完成天使輪融資。