通過建立我國分子診斷技術(shù)臨床科研和應(yīng)用協(xié)作網(wǎng)絡(luò),還可以對現(xiàn)有的人才、技術(shù)、資源和信息進(jìn)行整合,形成基因診斷專業(yè)技術(shù)人才的培訓(xùn)基地,為社會輸送能夠從事基因組大數(shù)據(jù)解讀和分子診斷臨床應(yīng)用研究與技術(shù)開發(fā)的專業(yè)人才,這對于建立我國基于基因組大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究體系和相關(guān)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有里程碑的意義。
當(dāng)談到如何將大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為精準(zhǔn)醫(yī)療的知識時,呂有勇教授認(rèn)為,面對大數(shù)據(jù),需要我們要突破四道阻力大障礙:即數(shù)據(jù)量大、類型繁多、價值密度低、速度快、時效高;因此,需要我們具備預(yù)測和判斷能力、提煉和排除能力、集成和驗證能力、分類和評價能力。同時他進(jìn)一步強調(diào),大數(shù)據(jù)的解讀是普通計算機無法完成的,計算機的計算能力和急劇上升的生物數(shù)據(jù)之間存在巨大差距,特別是云計算中心建立的問題。例如,我們參與國際腫瘤基因組協(xié)作聯(lián)盟的研究工作,美、加、英、德、日、韓幾個國都已建立云計算中心支撐這項工作、我們在理念和具體實施方案上有較大差距。因此在數(shù)據(jù)時代,未來生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的競爭將主要體現(xiàn)在數(shù)據(jù)資源和計算儲存資源兩方面。
云計算是連接大數(shù)據(jù)到精準(zhǔn)醫(yī)療的橋梁
云計算作為新興的IT技術(shù),允許用戶通過方便的網(wǎng)絡(luò)隨時獲取基礎(chǔ)計算資源,而無需添置與維護(hù)昂貴的用于大數(shù)據(jù)存儲與分析的高性能計算硬件資源,采用虛擬化技術(shù)可實現(xiàn)計算資源的快速擴展,用戶可以根據(jù)自己的存儲分析需求,快速調(diào)整資源配置,經(jīng)濟靈活。
呂有勇教授指出,云計算技術(shù)的成熟為生物大數(shù)據(jù)的解讀及精準(zhǔn)醫(yī)療提供了不可想象的發(fā)展空間。高通量測序數(shù)據(jù)分析、以及各類高通量生物學(xué)計算都將通過云計算與云存儲等制定化服務(wù)及統(tǒng)一的分析流程的方式完成,而科研人員自己構(gòu)建本地的計算平臺與分析流程可能難以實現(xiàn)上述目標(biāo)。因此,以我國現(xiàn)有的具有生物資源優(yōu)勢的醫(yī)療機構(gòu)和生物技術(shù)公司的人才、技術(shù)和條件優(yōu)勢為基礎(chǔ),建立統(tǒng)一的大數(shù)據(jù)計算構(gòu)架、大數(shù)據(jù)存儲與管理方案、大數(shù)據(jù)挖掘方法與流程,云技術(shù)的出現(xiàn)為科研領(lǐng)域提供了解決方案,研究者可以通過網(wǎng)絡(luò)很方便的按照分析需求從云平臺服務(wù)商那里獲取廉價且靈活擴展的計算資源,從而滿足大數(shù)據(jù)存儲、管理、和智能分析的要求。
呂有勇教授表示:他們一直在國內(nèi)尋求與具有生物信息學(xué)背景的云平臺提供商開展精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究,借助云技術(shù)聯(lián)合開展大數(shù)據(jù)處理、存儲、管理等方案。
百邁客是主要從事高通量基因組測序與生物信息分析的服務(wù)商,率先推出了用于高通量測序與生物信息分析的商業(yè)化云計算平臺。利用百邁客生物云平臺進(jìn)行大數(shù)據(jù)分析,對人群進(jìn)行基因組或轉(zhuǎn)錄組研究,解析其疾病調(diào)控機理或?qū)ふ疑飿?biāo)志物,可以更好地找到最適合的個性化醫(yī)療方案。此外,百邁客云的基因數(shù)據(jù)分析與可視化技術(shù)是世界領(lǐng)先的;扎實的技術(shù)保障可以幫助研究人員更好地從大規(guī)模基因測序數(shù)據(jù)中獲得致病基因或生物標(biāo)記的相關(guān)信息;使用起來確實非常方便,研究人員只需要按照步驟點擊幾下,即可以通過PC或者Pad就可以查看數(shù)據(jù)解讀結(jié)果。
呂有勇教授最后還補充道:毫無疑問云計算作為連接大數(shù)據(jù)到精準(zhǔn)醫(yī)療的橋梁,在精準(zhǔn)醫(yī)療的建設(shè)過程中發(fā)揮著舉足輕重的作用,我們不能錯失發(fā)展的機遇。
呂有勇:北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院二級教授,北京市腫瘤防治研究所資深研究員、博士生導(dǎo)師; 國家杰出青年基金獲得者,北京大學(xué)(醫(yī)學(xué)部)優(yōu)秀人才獎勵計劃和美國中華醫(yī)學(xué)會杰出教授獎獲得者,全國百名青年醫(yī)學(xué)科技新星稱號,國務(wù)院特殊津貼專家?,F(xiàn)擔(dān)任北京環(huán)境誘變劑學(xué)會副理事長,國際病理學(xué)雜志(Journal of pathology )編委,國家973健康科學(xué)領(lǐng)域?qū)<医M成員,中國醫(yī)師協(xié)會科技促進(jìn)委員會委員。從事腫瘤細(xì)胞及分子生物學(xué)的研究工作30余年,進(jìn)行腫瘤相關(guān)基因的鑒定、克隆及生物學(xué)功能研究,先后參加和主持863計劃,國家973腫瘤項目,國家杰出青年科學(xué)基金,北京市科委重點項目,國家自然科學(xué)基金等二十余項研究課題。在國內(nèi)外核心期刊 (Cancer Res, Mol.Cell Bio, Carcinogenesis, Oncogene, Clin Cancer Res, J Proteom Res,JCO,Nature, PNAS, Gut, Gastroenterology,Cell Res等)發(fā)表論文和述評200余篇,獲國家、軍隊和省部級成果10余項,申請國家發(fā)明專利多項。