有史以來，計算機第一次不依靠人類的任何幫助，僅僅通過人工智能獨立發(fā)現(xiàn)了一個新的科學(xué)理論。

　　來自塔夫斯大學(xué)的計算和生物領(lǐng)域的科學(xué)家們編碼了這樣一套程序，它能夠讓計算機在面對一個新的科學(xué)問題的時候，獨立地發(fā)展出一套解釋這個問題的理論。他們選擇的是一個在生物領(lǐng)域里困惑科學(xué)家們120年之久的現(xiàn)象：渦蟲(Planaria)被切開之后是有能力進行再生，形成一個新的個體的。這個奇怪的現(xiàn)象很久之前就被發(fā)現(xiàn)了，但至于為什么會發(fā)生，目前還沒有明確的答案。

　　然而，當(dāng)把這個問題交給計算機的時候，它就能通過逆向工程(reverseengineer)來找出一個能夠解釋這個過程背后機制的理論。具體的細節(jié)以及人工智能的方法被發(fā)表在最近的PLOSComputationalBiology上。

　　研究者們表示，他們真正想要發(fā)現(xiàn)的并非一個新的器官是如何再生的，而是機體如何指導(dǎo)這個新生的器官長成需要的樣子和大小。這些神秘的信息就隱藏在基因之中。

　　“現(xiàn)在，從遺傳實驗中得到的大部分再生模型都是些充滿了箭頭的圖表，告訴你這個基因調(diào)控那個基因，這當(dāng)然沒什么問題，但是，它并不能告訴你器官最終會發(fā)育成什么樣子，你也不能從這些遺傳調(diào)控通路模型中去得知這個機體最終是會長成一棵樹呢，還是一只章魚?；蛘呤亲罱K變成人類。”研究者之一的Levin這樣表示。“那些模型只是能夠告訴你再生發(fā)生的時候哪些成分是必不可少的，但它無法展示給你這個再生的過程是如何一步步發(fā)生的。”

　　所以，研究者想要用算法建立一個新的再生模型，它能夠告訴我們，給予生物體怎樣的刺激就能夠?qū)е乱粋€特定的成分再生。為了解決這一難題，研究者們利用進化計算的思想發(fā)展了一個算法，這個算法能夠?qū)崿F(xiàn)“自我進化”，并且能夠精準預(yù)測研究人員在渦蟲再生實驗中所獲得的研究數(shù)據(jù)。他們希望通過這個算法找到一個能夠解釋所有已發(fā)表實驗數(shù)據(jù)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

　　人工智能獨立攻克生物領(lǐng)域120年的未解之謎

　　那么這個調(diào)控網(wǎng)絡(luò)具體是怎樣找到的呢?

　　也許你已經(jīng)想到了，一開始的時候，“未進化”的隨機產(chǎn)生的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)一般是不會產(chǎn)生任何與真實實驗相同的結(jié)果的。新的候選調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的產(chǎn)生是結(jié)合之前已經(jīng)存在的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并在此基礎(chǔ)上做隨機的刪減增加。所有的候選網(wǎng)絡(luò)都會在模擬試驗中進行檢測，算法會把那些通過這個候選調(diào)控網(wǎng)絡(luò)發(fā)育出來的結(jié)果和數(shù)據(jù)庫里真實的實驗數(shù)據(jù)作對比。在這個“進化”過程中，就會逐漸產(chǎn)生新的能夠解釋更多實驗數(shù)據(jù)的候選調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

　　研究者們最終把這個算法應(yīng)用到由渦蟲再生的16個關(guān)鍵實驗數(shù)據(jù)所構(gòu)成的數(shù)據(jù)庫中，希望找到一個能夠全面解釋渦蟲再生的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。42小時之后，這個算法給出了一個能夠精準模擬出16個關(guān)鍵實驗全部實驗數(shù)據(jù)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型，這個新的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)包含了其中已知的重要調(diào)控分子以及兩個還未發(fā)現(xiàn)的蛋白。

　　對于這樣一個振奮人心的實驗結(jié)果，研究人員們表示：“這個項目最大的意義在于，我們所獲得是并不是一個異常復(fù)雜、無法理解的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，相反，結(jié)果表明人工智能是可以幫助我們來發(fā)現(xiàn)一個簡潔的、易于理解的模型。這意味著人工智能可以滲透到現(xiàn)代研究的任何一個領(lǐng)域，不僅僅是對實驗中產(chǎn)生的大數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)挖掘，同時還可以幫助我們?nèi)ダ斫膺@些復(fù)雜數(shù)據(jù)背后的簡潔原理。”