宇宙、生命和霧霾,這些困擾人類的難題是全球成千上萬的科學家們致力于研究的領域,大學生挑戰(zhàn)這三大難題似乎聽上去有些“天方夜譚”。5月18日,2015 ASC世界大學生超級計算機競賽(ASC15)將在太原理工大學舉行,來自全球16支高校代表隊的近百名大學生們,將用自己的智慧和創(chuàng)造力,嘗試提高宇宙探索、生命科學和霧霾研究中的超級計算效率。
即將開始的ASC15總決賽選定了7道各具價值的超算試題,將全面考察大學生對前沿科學研究的超算應用知識和能力。其中,全球最大天文學國際合作項目SKA(平方公里陣列望遠鏡)的數(shù)據(jù)處理軟件Gridding,廣泛應用在生命科學領域的納米尺度的分子動力學軟件NAMD,以及目前最先進、應用最廣泛的空氣質量數(shù)值預報模式WRF-CHEM, 直指宇宙探索、生命奧秘和霧霾預報領域的計算效率問題。這也讓人更加關注,大學生們是否能夠憑借自己的智慧和創(chuàng)造力,完成挑戰(zhàn)。
Gridding是SKA數(shù)據(jù)處理過程中是最耗時的步驟之一。在宇宙研究中,科學家們無法對射電望遠鏡接收到的數(shù)據(jù)進行直接解讀,而是需要對這些數(shù)據(jù)進行“加工”,生成一幅幅的天空圖像,從不同周期的天空圖像中發(fā)現(xiàn)星體軌跡、星球誕生和滅亡等種種變化并進行研究。Gridding軟件的作用簡單來說,就是將機器能識別的數(shù)據(jù)轉換成科學家們能看懂的圖像。然而,SKA每秒采集的數(shù)據(jù)量計劃大于12Tb,相當于2013年底中國互聯(lián)網國際出口帶寬的3.5倍,其中接近50%的海量天文數(shù)據(jù)需要Gridding軟件進行處理。這種規(guī)模的數(shù)據(jù)按照現(xiàn)有的技術,需要動用百億億次級別的超級計算機才能完成處理,投資巨大且不說,單單每年的電費支出就將是一筆天文數(shù)字。因此,SKA的科學家們希望能夠通過ASC15大賽,對Gridding進行MIC眾核并行優(yōu)化,大幅提高數(shù)據(jù)處理的速度,從而降低對高性能計算平臺的硬性需求。據(jù)透露,本次經過各參賽隊伍優(yōu)化后的結果,將反饋給SKA組織參考采用。
NAMD能夠在大規(guī)模并行計算機上快速模擬大分子體系,并從幾百個內核的典型模擬擴展到超越 500,000 內核的最大模擬。這一軟件曾獲得過2002年超算界最高榮譽的戈登·貝爾獎和2012年的西德尼·費恩巴赫獎,是生命科學研究領域“皇冠”上最耀眼的“明珠”之一。
WRF-CHEM已經成為世界各國預測霧霾以及PM2.5顆粒、PM10顆粒、二氧化硫等有害空氣成分變化的主要技術手段。眾所周知,霧霾研究的前提需要建立在對霧霾有深刻了解的基礎上,WRF-CHEM有價值之處在于,科學家們可以依據(jù)觀測到的各種空氣化學成分數(shù)據(jù),在超級計算機上模擬霧霾形成的過程,并通過改變不同的化學反應參數(shù),來與最終實際檢測到的霧霾進行對比,從而發(fā)現(xiàn)霧霾形成的真正原因。不過,由于大氣中的化學成分極其復雜,當模型越接近真實情況,則意味著計算機模擬需要進行的運算量越大,耗費的時間會越長。因此,提高WRF-CHEM的運行效率,有助于更快的開展對霧霾的各種研究。
科技的進步讓我們解決了很多之前無法克服的難題,同時也讓我們發(fā)現(xiàn)了更多的問題。然而,在這一過程中,人類對自然的認識更加深刻,征服自然、改造自然的能力也隨之提升。對于參加ASC15的大學生們來說,挑戰(zhàn)成功與否或許并不是那么重要,重要的是在挑戰(zhàn)的過程中,能夠讓自己加深世界的認識,在深邃而迷人的科學世界中邁出向前的一步。
ASC世界大學生超級計算機競賽是由亞洲發(fā)起的世界最大規(guī)模的大學生超算競賽,由中國倡議成立,與日本、俄羅斯、韓國、新加坡、泰國、中國臺灣、中國香港等國家和地區(qū)的超算專家和機構共同發(fā)起并組織,并得到美國、歐洲等國家地區(qū)超算學者和組織的積極響應支持。ASC競賽旨在通過大賽的平臺,推動各國及地區(qū)間超算青年人才交流和培養(yǎng),提升超算應用水平和研發(fā)能力,發(fā)揮超算的科技驅動力,促進科技與產業(yè)創(chuàng)新。