許多解決方案和產(chǎn)品可應(yīng)用于該模型中成為可部署平臺(tái),用于基因組研究、數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化和個(gè)性化醫(yī)療,如開(kāi)源解決方案Galaxy,IBM頻譜系解決方案GPFS™等。
以參考架構(gòu)為藍(lán)本增長(zhǎng)
對(duì)端到端參考架構(gòu)的另一項(xiàng)需求,是通過(guò)集成能被映射到不同需求的各種新舊構(gòu)建塊,使平臺(tái)和基礎(chǔ)設(shè)施有機(jī)增長(zhǎng),這些構(gòu)建塊可以是不同的類型、模式、大小和系統(tǒng)架構(gòu),如獨(dú)立服務(wù)器、云虛擬機(jī)、高性能計(jì)算集群、低延遲網(wǎng)絡(luò)、擴(kuò)展型存儲(chǔ)系統(tǒng)、大數(shù)據(jù)集群、磁帶歸檔或元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)等等。對(duì)于可融入架構(gòu)的構(gòu)建塊,需遵循行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)格式,通用軟件框架和硬件協(xié)同操作性三項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn),這樣實(shí)施和擴(kuò)展基因組基礎(chǔ)設(shè)施可以多種靈活的方式進(jìn)行:
小規(guī)模起步:由于是基于軟件定義,如果關(guān)鍵能力和功能到位,為符合有限的預(yù)算,系統(tǒng)、平臺(tái)和基礎(chǔ)設(shè)施可以相當(dāng)小。例如,臨床測(cè)序?qū)嶒?yàn)室可部署一個(gè)僅由1至2個(gè)服務(wù)器組成的小型系統(tǒng),并提供少量磁盤存儲(chǔ)和關(guān)鍵軟件進(jìn)行管理。
快速增長(zhǎng):由于計(jì)算和存儲(chǔ)的增長(zhǎng),已有的基礎(chǔ)設(shè)施可在不中斷操作的情況下迅速擴(kuò)展到很大規(guī)模。如2013年底,錫德拉灣醫(yī)療研究中心建立了屬于它們自己的基因組研究基礎(chǔ)設(shè)施,隨后通過(guò)參考架構(gòu)添加了一個(gè)新的構(gòu)建塊(60個(gè)節(jié)點(diǎn)的高性能計(jì)算集群),最終于2014年中期將存儲(chǔ)基礎(chǔ)設(shè)施增加了三倍。這一健壯的能力使得錫德拉灣成為阿拉伯卡塔爾基因項(xiàng)目的基礎(chǔ)設(shè)施供應(yīng)者。