圖7 用編排器集成的基因組工作流
圖中從左至右依次有以下部件：
- 框1：數(shù)據(jù)(如BCL文件)到達(dá)后自動(dòng)觸發(fā)CASAVA作為工作流第一步。
- 框2：動(dòng)態(tài)子流使用BWA比對(duì)序列。
- 框3：Samtool以作業(yè)數(shù)組的運(yùn)行方式進(jìn)行后處理。
- 框4：不同的變型分析子流并行被觸發(fā)。
基因組工作流結(jié)合一些應(yīng)用程序和工具，把原始序列數(shù)據(jù)(BCL)處理為變型(VCF)數(shù)據(jù)。每個(gè)框表示一個(gè)工作流功能模塊，它由映射到功能的基因組應(yīng)用程序組成，如基因組堿基轉(zhuǎn)換、序列比對(duì)、前處理、以及變型提取和分析。這些模塊自身可作為獨(dú)立工作流被集成，并按照邏輯和條件關(guān)系被連接到一個(gè)更大的工作流中。